「ソース管理」機能管理下にあるプロジェクトフォルダには"CVS"というフォルダが作成されます。
ここでは「ソース管理」に必要な各種情報が格納されます。このフォルダを削除したり、ファイルを変更したりしないでください。
「ソース管理」が正常に動作せず最悪の場合ファイルを破損する場合があります。
「リポジトリから更新・マージ」コマンドを実行します。
リポジトリから最新リビジョンのファイルが取得できます。
プロジェクトファイルを削除してしまい、プロジェクトをオープンできなくなってしまった場合、新たにプロジェクトを作成するのではなく「プロジェクトのダウンロード」でプロジェクト全体をダウンロードします。
そこにローカルで変更状態にあるファイルを上書きすれば元の状態へ復帰できます。